W myśl art. 94 Konwencji Wykonawczej do Układu z Schengen System Informacyjny Schengen zawiera jedynie te kategorie danych dostarczonych przez umawiające się strony wymaganych we wskazanych przez Konwencję celach. Kategorie danych wprowadzane do Systemu obejmują zgodnie z ustępem 2 tego artykułu osoby, w przypadku których został wprowadzony wpis, oraz przedmioty określone w art. 100 Konwencji Wykonawczej do Układu z Schengen i pojazdy silnikowe wskazane w art. 99 tej Konwencji. Dane o osobach, których dotyczy wpis wprowadzony do Systemu Informacji Schengen, mogą obejmować jedynie:
- nazwisko i imiona, wszelkie pseudonimy, wprowadzane, o ile to możliwe, oddzielnie,
- wszelkie szczególne cechy fizyczne, niepodlegające zmianom,
- datę i miejsce urodzenia,
- płeć,
- obywatelstwo,
- informację, czy dana osoba jest uzbrojona, agresywna bądź zbiegła,
- przyczynę wpisu,
- proponowane działania.
Wskazać należy, że wprowadzanie do Systemu Informacyjnego Schengen innych informacji, a zwłaszcza danych wymienionych w art. 6 zd. 1 Konwencji 108, tj. danych ujawniających pochodzenie rasowe, poglądy polityczne, przekonania religijne lub inne, oraz danych osobowych dotyczących zdrowia lub życia seksualnego, jest zabronione.
Zgodnie z przepisami art. 95-99 Konwencji Wykonawczej do Układu z Schengen w Systemie Informacyjnym Schengen przetwarzane są wpisy dotyczące:
- osób poszukiwanych celem aresztowania ekstradycyjnego,
- cudzoziemców, którym odmawia się prawa wjazdu,
- osób zaginionych bądź osób, które dla ich własnej ochrony lub w celu zapobiegnięcia zagrożeniom należy tymczasowo oddać pod opiekę policji,
- świadków, osób wezwanych do stawienia się przed organami sądowymi w związku z postępowaniem karnym w celu poniesienia odpowiedzialności, osób, które powinny odbywać wyrok w sprawie karnej lub wezwanych do stawienia się w celu odbycia kary pozbawienia wolności,
- nadzoru niejawnego osób lub pojazdów.
Ponadto stosownie do postanowień art. 100 Konwencji Wykonawczej do Układu z Schengen we wskazanym powyżej systemie przetwarza się dane dotyczące przedmiotów niezbędne do celów ich zajęcia lub wykorzystania w charakterze dowodu w postępowaniu karnym. Do przedmiotów tych, zgodnie z ustępem 3 tego artykułu, zalicza się: pojazdy silnikowe o pojemności silnika przekraczającej 50 cm
3, które zostały skradzione, wykorzystane w niewłaściwy sposób lub utracone, przyczepy i naczepy o masie własnej przekraczającej 750 kg, które zostały skradzione, wykorzystane w niewłaściwy sposób lub utracone, broń palną, która została skradziona, wykorzystana w niewłaściwy sposób lub utracona, urzędowe blankiety, które zostały skradzione, wykorzystane w niewłaściwy sposób lub utracone, wydane dokumenty tożsamości (paszporty, dowody tożsamości, prawa jazdy), które zostały skradzione, wykorzystane w niewłaściwy sposób lub utracone, oraz podejrzane banknoty.